Sci Rep:5-miRNA标签构造可作为食管鳞状细胞癌的预后生物标志物

2022-01-24 00:14:51 来源:
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这项研究宗旨相符一种可以信息归纳食管鳞状肝细胞癌(ESCC)病患者各个方面生存率(OS)的miRNAs附加。

从NCBI GEO获得119名ESCC病患者的miRNA表达谱及其相应的临床信息,并将其作为培训集。在早期和晚期检验间选取关联表达的miRNAs(DEmiRNAs)。使用Cox回归归纳、递回特征消除(RFE)-默许向量一号机(SVM)启发式和LASSO Cox回归仿真来辨认病症病态miRNAs,从而构建病症分数仿真。此外,信息归纳了这些病症病态miRNAs的有前途靶基因,然后构建了miRNA靶基因网络平台。通过机制可溶病态归纳,归纳了ESCC中这些病症病态miRNAs信息归纳靶基因的机制方面病态。

在培训集中,早期与晚期检验有46个DEmiRNAs。构建了基于5个miRNAs的风险分数仿真。该5-miRNA风险分数可以将培训集分为OS等待时间明显不同的高危组和低危组。在一个来自癌症序列著者(TCGA)的独立信息集中,成功验证了5-miRNA风险分数的风险分层能力。已相符了与这些miRNAs方面的各种生物学步骤和自营,例如Wnt接收器自营、TRP连接线的上皮肝细胞介质调节自营和睾酮接收器自营。

这项研究提示,与病理分期方面的5-miRNA附加对信息归纳ESCC病患者的病症具有临床意义。

原始典故:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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