献给初学者:常用的细胞凋亡检查方法

2022-01-03 00:13:30 来源:
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在实验室里面经常需检验细胞质的其会情况下,这里归纳了几种常见的其会检验步骤,希望必须帮到你。

一细胞质其会的遗传学检验

频发其会的细胞质在有机体上有一定的特质。

光学电子显微镜和一整电子显微镜

未漂白细胞质:其会细胞质的表面积变稍长、变形,细胞质薄膜明晰但浮现橡胶现象,细胞质其会中后期可见其会小棒突起。贴壁细胞质浮现皱缩、变圆、开裂。

漂白细胞质:常用姬姆萨漂白、瑞氏漂白等。其会细胞质的肌动蛋白酶精制、局外人,核能薄膜硫化、肌动蛋白酶分割成块突起和其会小棒突起等类似于的其会有机体。

萤光电子显微镜和总而所聚焦微波扫描电子显微镜

一般以细胞质核能肌动蛋白酶的遗传学改变为测试方法来入围者细胞质其会的进展情况下。

常用的 DNA 酪氨酸衍生物有:HO 33342(Hoechst 33342),HO 33258(Hoechst 33258),DAPI。三种衍生物与 DNA 的辅以都是非应用软件的,主要辅以在 DNA 的 A-T DNA区。紫外光促使时发射明亮的蓝色萤光。

Hoechst 是与 DNA 特异辅以的活命性衍生物,填充试管用蒸馏水混和 1 mg/ml 的浓度,用到时用 PBS 浓缩,方才浓度为 10 μg/ml。

DAPI 为半通透性,主要用途常规固定细胞质的漂白。填充试管用蒸馏水混和 1 mg/ml 的浓度,用到方才浓度一般为 10 μg/ml。

结果入围者

细胞质其会操作方律过程里面细胞质核能肌动蛋白酶的遗传学改变分为三期:Ⅰ 期的细胞质核能长方形纹路突起(rippled)或长方形直缝样(creased),部分肌动蛋白酶浮现精制突起态;Ⅱa 期细胞质核能的肌动蛋白酶相对凝聚、局外人;Ⅱb 期的细胞质核能硫化为碎裂,归因于其会小棒突起(示意图 1)。

透射电子电子显微镜观察

结果入围者

其会细胞质表面积变稍长,细胞质质精制。其会Ⅰ期(pro-apoptosis nuclei)的细胞质核能内肌动蛋白酶相对盘绕,浮现许多称作气穴现象(citations)的空泡结构;Ⅱa 期细胞质核能的肌动蛋白酶相对凝聚、局外人;细胞质其会的中后期,细胞质核能硫化为碎裂,归因于其会小棒突起(示意图 2)。

二Annexin V 律

磷脂胺丝氨酸(Phosphatidylserine, PS)情况下下设于细胞质薄膜的内侧,但在细胞质其会的20世纪,PS 可从细胞质薄膜的内侧滑动到细胞质薄膜的表面,暴露在细胞质外环境里面(示意图 3)。Annexin-V 是一种反应性为 35~36 KD 的 Ca2+ 依赖性磷脂辅以蛋白酶,能与 PS 较低张力酪氨酸辅以。将 Annexin-V 完成萤光素(FITC、PE)或 biotin 标识,以标识了的 Annexin-V 作为萤光多肽,借助于流式细胞质仪或萤光电子显微镜可检验细胞质其会的频发。

碘化丙啶(propidine iodide, PI)是一种多肽衍生物,它必须来完成明晰的细胞质薄膜,但在其会里面叶的细胞质和亡细胞质,PI 必须来完成细胞质薄膜而使细胞质核能红染。因此将 Annexin-V 与 PI 匹配用到,就可以将其会要到中后期的细胞质以及亡细胞质划隔开去。

步骤

悬浮细胞质的漂白:将情况下下培育出和其会其会的悬浮细胞质(0.5~1×106)用 PBS 浸 2 次,投身 100 μl Binding Buffer 和 FITC 标识的 Annexin-V(20 μg/ml)10 μl,常压避光 30 min,再投身 PI(50 μg/ml)5 μl,避光质子化 5 min 后,投身 400 μl Binding Buffer,马上用 FACScan 完成流式细胞质妖术一原理检验(一般不超过 1 h), 同时以不沙 AnnexinV-FITC 及 PI 的一管作为单总共相异。

贴壁培育出的细胞质漂白:先行用 0.25% 的胰蛋白酶消化道,干净、漂白和总共据分析同悬浮细胞质。

爬上片细胞质漂白:同上,最终用萤光电子显微镜和总而所聚焦微波扫描电子显微镜完成观察。

结果

提醒事项

1. 整个操作方律动作要尽参数轻柔,时时用力吹打细胞质。

2. 操作方律时提醒避光,质子化完后尽快在一全程内检验。

三核能糖棒突起薄膜势能的检验

核能糖棒突起在细胞质其会的操作方律过程里面起着门户依赖性,多种细胞质其会性刺激系总共之外可其会各有不同的细胞质频发其会,而核能糖棒突起跨越稳定突起态(Δψm)的下降,被视为是细胞质其会适配质子化操作方律过程里面最要到频发的流血事件,它频发在细胞质核能其会特质(肌动蛋白酶精制、DNA 崩落)浮现之前,一旦核能糖棒突起跨越稳定突起态崩溃,则细胞质其会经年累月。

核能糖棒突起跨越稳定突起态的存有,使一些极性阳离子萤光衍生物如 Rhodamine 123、3,3-Dihexyloxacarbocyanine iodide(DiOC6)、Tetrechloro-tetraethylbenzimidazol carbocyanine iodide(JC-1)、Tetramethyl rhodamine methyl ester(TMRM)等可辅以到核能糖棒突起基质,其萤光的增强或弱化说明核能糖棒突起内薄膜电负性的增沙或增加。

步骤

将情况下下培育出的细胞质和其会其会的细胞质投身用到方才浓度为 Rhodamine 123(1 mM)或方才浓度为 DiOC6(25 nM),JC-1(1 mM),TMRM(100 nM),37 °C 恒定 30 min,流式细胞质而所检验细胞质的萤光低压。

提醒事项

1. 始方才保持恒定染试管里面 pH 参数的正确性,因为 pH 参数的推移将影响稳定突起态。

2. 与衍生物翻倍恒定的细胞质悬试管里面如果计有有蛋白酶,他们将与部分衍生物辅以,增加衍生物的浓度,引起假去极化。

四DNA 段落化检验

细胞质其会时主要的生化特质是其肌动蛋白酶频发精制,肌动蛋白酶 DNA 在核能小棒突起单位之间的连接处崩落,长方形现出 50~300 kbp 稍长的 DNA 大段落,或 180~200 bp 整总共倍的寡核能苷酸段落,在胶突起气相上表现为四边形气相示意图谱(DNA ladder)。

细胞质经管控后,采用常规步骤复合蒸馏 DNA,完成琼脂糖胶突起气相和溴化乙啶漂白,在其会细胞质群里面可观察到类似于的 DNA ladder。如果细胞质参数较少,还可在复合蒸馏 DNA 后,用 32P-ATP 和多肽核能苷酸一端移出蛋白酶(TdT)标识 DNA,然后完成气相和放射自冲洗,观察其会细胞质里面 DNA ladder 的长方形现出。

大化学键漂白棒突起 DNA 段落的测定

细胞质其会的20世纪,漂白棒突起崩落成为 50~300 kbp 稍长的 DNA 大段落。所有超过一定反应性一般来说的双链 DNA 化学键在琼脂糖胶突起里面的迁移速度相同。离散 DNA 的脱氧核糖核酸表面积超过胶突起表面积时,即翻倍分辨力的极限。此时胶突起早已按反应性的一般来说来筛分 DNA,DNA 像通过弯管一样,以其一端指向动参数一极而通过胶突起,这种迁移模式称之为「爬上行」。因此,细胞质其会20世纪归因于的 50~300 kbp 稍长的 DNA 大段落必须用普通的琼脂糖胶突起气相来复合。

举例来说采用较低频率气相技妖术可圆满地妥善解决这一问题。这个步骤是在胶突起上外沙正交的交变较低频率动参数。每当动参数方向改变后,大的 DNA 化学键之后逗留在爬上行管里面,方才重新动参数侧向重新定向后,才能继续向前移动。DNA 反应性越大,这种重排所需的时间段就越稍长。当 DNA 化学键线性变换方向的时间段小于电较低频率短周期时,DNA 就可以按其反应性一般来说隔开。

DNA Ladder 测定

步骤

获得好评细胞质(1×107)硫酸盐→细胞质硫化试管→13 000 rpm ×5 min→利用上明末清初,沙 1% SDS 和 RnaseA(5 mg/ml)56 °C,孵蛋 2 h→蛋白酶蛋白酶 K(2.5 mg/ml)37 °C,2 h→1/10 表面积 3 mol/l 醋酸钠和 2.5 倍表面积的冻无水甲醇硫酸盐 DNA,4 °C 住处→14 000 rpm×15 min→最终将硫酸盐溶解在 TE buffer 里面,沙 DNA Loading Buffer→1.2% 琼脂糖胶突起气相,EB 漂白并摄像。

结果

其会细胞质 DNA 浓度的流式细胞质而所总共据分析

步骤

利用细胞质→70% 冻甲醇(PBS 浓缩)4 °C 固定住处→PBS 干净,1 000 rpm × 10 min→RNase A(0.5 mg/ml)37 °C 消化道 30 min→PI(50 mg/ml)漂白,常压避光 15 min→FACScan 总共据分析 DNA 亚二倍棒突起的长方形现出及细胞质短周期的推移。

结果

ApoAlertTM LM-PCR Ladder Assay

优点:敏感度较低,适宜检验少参数检验,小部分其会细胞质。如临床活命许多组织检验。

五TUNEL 律

细胞质其会里面,漂白棒突起 DNA 双链崩落或单链崩落而归因于大参数的疏松 3'-OH 一端,可在多肽核能苷酸一端移出蛋白酶(TdT)的依赖性下,将多肽核能苷酸和萤光素、过氧化物蛋白酶、碱性磷酸蛋白酶或糖类长方形现出的衍生物标识到 DNA 的 3'-一端,从而可完成其会细胞质的检验,这类步骤称作多肽核能苷酸一端移出蛋白酶酪氨酸的缺口一端标识律(terminal -deoxynucleotidyl transferase mediated nick end labeling, TUNEL)。

由于情况下下的或打算游离的细胞质几乎不会 DNA 的崩落,因而不会 3'-OH 长方形现出,较少必须被漂白。TUNEL 其实是化学键生物学与遗传学相辅以的科学研究步骤,对明晰的单个其会细胞质核能或其会小棒突起完成移置漂白,能准确地质子化细胞质其会类似于的化学和有机体特质,可主要用途煤油包埋许多组织薄片、的水许多组织薄片、培育出的细胞质和从许多组织里面复合的细胞质的细胞质有机体测定,并可检验出极少参数的其会细胞质,因而在细胞质其会的科学研究里面被广泛采用。

六Caspase-3 活命性的检验

Caspase 家族在酪氨酸细胞质其会的操作方律过程里面起着非常重要的依赖性,其里面 Caspase-3 为极其重要的执行化学键,它在其会信号传导的许多途径里面发挥新功能。Caspase-3 情况下下以蛋白酶原(32 KD)的表达方式存有于溶酶体里面,在其会的20世纪之前,它被诱导命,再生的 Caspase-3 由两个大氨基酸(17 KD)和两个小氨基酸(12 KD)组成,硫化适当的溶酶体胞核能基团,最方才引致细胞质其会。但在细胞质其会的中后期和被害细胞质,Caspase-3 的活命性明显下降。

Western blot

总共据分析 Procaspase-3 的再生,以及再生的 Caspase-3 及对基团多聚(ADP-核能糖)聚合蛋白酶(PARP)等的硫化。

步骤

利用细胞质→PBS 干净→抽提细胞质硫化试管→蛋白酶一原理→SDS-PAGE 气相→纤维素薄膜或 PVDF 薄膜移出→5% 脱脂明末清初空,常压 1.5~2 h 或 4 °C 住处→Caspase-3 多抗或单抗常压质子化 1~2 h 或 4 °C 住处→TBS-T(计有 0.05% Tween 20 的 TBS)浸 3 次,5~10 min/次→HRP-标识的山羊抗鼠 IgG 或 AP 标识的山羊抗鼠 IgG 常压质子化 1~2 h→ TBS-T 浸 3 次, 5~10 min/次→ECL 冲洗或 NBT/BCIP 过氧化。

结果

萤光分光光度而所总共据分析

再生的 Caspase-3 必须特异切割 D1E2V3D4-X 基团,歧化 D4-X 肽键。根据这一特点,设而所出萤光物质酪氨酸的短肽 Ac-DEVD-AMC。在总而所价酪氨酸时,AMC 必须被促使萤光,短肽被歧化后释放出来出 AMC,自由的 AMC 才能被促使发射萤光。根据释放出来的 AMC 萤光低压的一般来说,可以测定 Caspase-3 的活命性,从而反映 Caspase-3 被再生的以往。

步骤

获得好评细胞质情况下下或其会细胞质→PBS 干净→较低纯度细胞质硫化试管→沙 Ac-DEVD-AMC(caspase-3 萤光基团)→37 °C 质子化 1 h→萤光分光光度而所(Polarstar)总共据分析萤光低压(促使光波稍长 380 nm,发射光波稍长为 430~460 nm)。

结果

流式细胞质妖术总共据分析

步骤

获得好评细胞质情况下下或其会细胞质→PBS 干净→沙 Ac-DEVD-AMC→37 °C 质子化 1 h→UV 流式细胞质而所总共据分析 Caspase-3 阳性细胞质总共和平之外萤光低压。

结果

七TFAR19 蛋白酶表达出来和细胞质有别于总共据分析

TFAR19(PDCD5)是由本科学实验室在国际上首先行引述的一个拥有自己知识产权的有机体新基因,中后期的新功能科学研究说明,它是增进细胞质其会的增强剂。借助于萤光素(FITC)标识的 TFAR19 单克隆病原棒突起为多肽,对细胞质其会操作方律过程里面 TFAR19 蛋白酶的表达出来较低度及有别于科学研究发现,其会20世纪 TFAR19 表达出来较低度增沙并浮现快速核能稍长号现象,牵动着细胞质核能遗传学的推移,持续较稍长时间段,在其会小棒突起里面仍然可见。

同时我们发现,其会20世纪 TFAR19 蛋白酶的核能稍长号要到于磷脂胺丝氨酸(PS)螺旋突起和细胞质核能 DNA 的段落化,提示 TFAR19 蛋白酶的核能稍长号是细胞质其会更20世纪频发的流血事件之一。进一步的科学研究断言,其会20世纪 TFAR19 的核能稍长号具有普遍意义,各有不同细胞质其会20世纪之外浮现 TFAR19 较低表达出来和核能稍长号。这为科学研究细胞质其会20世纪所频发的流血事件,提供了一种重新技妖术和测试方法。

TFAR19 蛋白酶的细胞质有别于总共据分析

材料醛

FITC 标识的单克隆病原棒突起,pH 7.4 、0.15 mol/L PBS,3% 的多聚甲醛,PBS-T(pH 7.4 、0.15 mol/L PBS 计有 0.2% Tween 20),胎牛毒素,萤光细胞质浸试管(pH 7.4 、0.15 mol/L PBS 计有 2% 胎牛毒素及 0.1% NaN3),FACS 管,Tip 背,移试管器。

仪器

低温较低度离心机,37 °C 水浴罐,萤光电子显微镜,总而所聚焦微波扫描电子显微镜,流式细胞质仪。

步骤

1. 悬浮细胞质的漂白

(1)获得好评情况下下和其会其会的细胞质(0.5~1×106),PBS 浸 2 次,1 000 rpm×10 min。

(2)3% 多聚甲醛冰浴 10 min,PBS 浸 2 次,1 000 rpm×10 min。

(3)投身 PBS-T 溶试管,37 °C 孵蛋 15 min,PBS 浸 2 次,1 000 rpm×10 min。

(4)投身 200 ml 胎牛毒素,常压质子化 30 min。

(5)投身 5 ml FITC 标识的 TFAR19 单抗(方才浓度为 1:40),4 °C 质子化 30 min。

(6)萤光细胞质浸试管浸 2 次,1 000 rpm×10 min。

将细胞质硫酸盐滴片,萤光电子显微镜及总而所聚焦微波电子显微镜下观察 TFAR19 在细胞质里面的有别于。同时用流式细胞质仪一原理检验 TFAR19 蛋白酶的平之外萤光低压。

2. 贴壁细胞质的移置漂白

(1)贴壁生稍长的下式期细胞质摊在 24 圆孔或 6 圆孔刷里面(内有洁净盖玻片),让其爬上片生稍长,待稍长到 50%~80 % 满时,其会其会剂管控细胞质。

(2)将各有不同时间段点管控的细胞质完成免疫萤光漂白,漂白步骤同上。

(3)将漂白的爬上片细胞质放于一张滴有少参数(5 ml)的载玻片上,萤光电子显微镜或总而所聚焦微波扫描电子显微镜观察 TFAR19 在细胞质里面的有别于。

3. 临床病理薄片的漂白、检验

4. 原代细胞质的培育出、检验

5. 总共据分析 TFAR19 蛋白酶在人棒突起内各许多组织人体器官的分布及有别于

TFAR19 蛋白酶的表达出来与临床疟疾

ELISA 律检验情况下下人和疟疾突起态下,以及疟疾的各有不同后期,毒素里面 TFAR19 蛋白酶较低度及其 TFAR19 自身病原棒突起较低度。

材料和醛

1. ;也 Buffer:pH 9.6, 0.05 mol/L 碳酸 Buffer

2. 干净试管: pH 7.4,0.15 mol/L PBS 计有 0.05% Tween 20

3. 明末清初空试管: 3% BSA(用干净试管配制)

4. 蛋白酶标病原棒突起的浓缩:用明末清初空试管浓缩

5. OPD 基团 Buffer:Na2 HPO4·12 H2O 1.84 g,柠檬酸 0.51 g,DDW 100 ml

6. 过氧化试管(现配另作):基团 Buffer 10 ml,OPD 2 mg,30% H2O2 2 ml

7. 方才止试管 2 mol/L H2SO4

8. 重新分配人 TFAR19,HRP 标识的山羊抗人 IgG9 ELISA 刷,Tip,移试管器,ELISA Reader(OD 490 nm),浸刷机

操作方律步骤

1. 用;也 Buffer 浓缩的重新分配人 TFAR19(1 mg/ml);也 ELISA 刷,100 ml/well,37 °C 孵蛋 2 h 或 4 °C 住处(一般 24 h 以上)。

2. 干净 Buffer 浸刷三次,投身明末清初空试管,200 ml/well , 37 °C 孵蛋 2 h 或 4 °C 住处。

3. 干净 Buffer 浸刷三次,投身各有不同浓缩度的医护人员毒素(3 个以此类推圆孔)100 ml/well ,37 °C 孵蛋 1 h。设;也 Buffer、干净 Buffer 、明末清初空试管为单总共相异。

4. 干净 Buffer 浸刷三次,投身 1:2 500 浓缩的 HRP 标识的抗人 IgG, 100 ml/well,37 °C 孵蛋 1 h。

5. 干净 Buffer 浸刷三次,投身过氧化试管,100 ml/well,避光质子化 10~15 min。

6. 投身 H2SO4 方才止质子化,50 ml/well。

7. ELISA Reader 读取 OD 490 光密度参数,总共据分析和相对医护人员毒素和情况下下血 明末清初里面 TFAR19 自身病原棒突起的表达出来较低度。

8. Western blot 总共据分析原发性细胞质和情况下下细胞质的 TFAR 19 蛋白酶的表达出来较低度。

注解

Brown,D.G., Sun, X.M., and Cohen, G.M.(1993) Dexamethasone-induced apoptosis involves cleage of DNA to large fragments prior to internucleosomal fragmentation. J. Biol.Chem. 268, 3037-3039

Herrmannm M, Lorenz HM, Voll R et al. A Rapid and simple method for the isolation of apoptotic DNA fragments. Nucleic Acid Res. 1994; 22:5506-5507

文中来源:雪莲园内站友 midas

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主编: 任悠悠

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